坚持自主创新、走产学研相结合的道路是益农成立以来较大的特色和优势，公司建立了符合市场经济和现代企业制度要求的经营机制，通过了ISO9001质量管理体系认证。构建了品种研发中心，品种测试中心，海南南繁基地，水稻分子试验室在内的独立完整研发体系；建成了遍布东三省和内蒙古不同生态区的44个测试点；积极与黑龙江省农科院、黑龙江大学，东北农业大学等开展科企合作；与法国RAGT公司、美国北达科他州立大学，爱荷华州立大学等国外种子公司和科研机构开展种质资源和育种技术的交流合作，大力进行农产品的科研开发。